Как открыть видео в отдельном окне Яндекс?

Нажмите → Настройки. Откройте Инструменты. В блоке Просмотр видео поверх других вкладок и программ отключите опцию Показывать на видеороликах кнопку для выноса видео или Автоматически открывать видео в отдельном окне.